1月5日，《内蒙古农业大学学报.自然科学版》入编《中文核心期刊要目总览》2008年版(即第五版)综合性农业科学类的核心期刊。
1月5日，全国财政工作会议上，我校张心灵教授荣获“全国先进会计工作者”荣誉称号。
1月９日，在国家科学技术奖励大会上，我校生态环境学院贺晓教授参与完成的项目《荒漠化地区大型煤炭基地生态环境综合防治技术》荣获2008年度国家科学技术进步二等奖。
1月21日，内蒙古自治区2008—2009年度我校新增本科专业有建筑学、会计学。
2月25日，内蒙古农业大学召开2009年学生工作会议。
3.月2日，教育部公布2008年87所普通高等学校本科教学工作水平评估结论，我校获得优秀。
3月4日，张和平教授主持完成的国内首张益生菌全基因组图谱绘制入选2008年内蒙古科技十大进展。我校张和平教授经过6年多分离、筛选和系统研究，开发出具有完全自主知识产权的益生菌，完成了益生菌L.casei Zhang的全基因组序列测定。这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。
3月13日，内蒙古农业大学职业技术学院升格为副厅级单位，核定学院领导职数6名，其中副厅级2名，正处级4名。
3月14日,我校举办2009届毕业生首场就业洽谈会。
3月18日，全区高校学生工作及维护稳定创建平安校园综合治理工作考核组来我校考核工作。
3月19日，召开我校2009年毕业生就业工作会议。农学院等12家单位获2008年毕业生就业工作达标单位并受到奖励。
3月20日,我校与兴安盟扎赉特旗合作协议签字仪式举行。我校将在经济、技术、项目、人才等领域与扎赉特旗进行合作交流，建立长期有效合作，实现双方互惠双赢。
3月24日，经国务院批准,我校周欢敏、高聚林教授荣获“2008年度政府特殊津贴专家”称号。
3月24日，我校25位专家入选自治区“新世纪321人才工程”。李金泉、芒来、王春光、王明玖、史海滨、刘廷玺入选第一层次人选。李国婧、闫祖威、姚凤桐、张七斤、敖长金、王纯洁、曹贵方、修长柏、乔光华、樊明寿、高永、贾玉山、石凤翎、靳烨、韩国栋、张和平、周欢敏、高聚林、薛河儒入选第二层次人选。
4月24日 国家留学基金委来华事务部副主任陈琳、项目主管王静和吴莎莎一行来我校考察留学生工作。
3月25日，内蒙古自治区政府副主席郭启俊在政府副秘书长于清理等领导的陪同下来我校考察工作。
4月25日 在自治区政府组织召开的“全区高校科技工作会议”上，我校被授予“全区高等学校科技创新先导型大学”；动物科学与医学学院被授予“全区高等学校科技创新先导型院（系）”；乳品生物技术与工程重点实验室被授予“全区高等学校科技创新先导型实验室”；张和平教授、李国婧教授、周欢敏教授分别被授予“全区高等学校科技创新标兵”。
3月26日，我校从3-9月开展深入学习实践科学发展观活动。
4月2日，团中央学校部部长李小豹同志任组长的全国大学生思想政治教育联合调研组一行七人在我校进行调研。
4月10日，举行内蒙古农业大学组建十周年纪念大会。自治区党委书记、自治区人大常委会主任储波，自治区党委副书记、自治区主席巴特尔，自治区党委常委、自治区党委秘书长符太增，自治区人大常委会副主任雷?额尔德尼，自治区政府副主席郭启俊，自治区政协副主席郭子明等自治区有关部门的领导出席大会。我校表彰了朝伦巴根等77名内蒙古农业大学改革建设和发展做出突出贡献的先进个人。
4月20日，“扬帆启航，创业青春”专场讲座暨新东方西部特困大学生专项助学金颁发仪式在我校举行。新东方教育集团有限公司董事长俞敏洪出席。
4月22日，召开我校2008年维护稳定社会治安综合治理总结表彰暨2009年工作部署大会。动物科学与医学学院等14个单位被授予“2008年度社会治安综合治理先进单位”，档案馆等3个单位被授予“2008年度防火工作先进单位”，水利与土木建筑工程学院教师潘和平被授予“见义勇为先进个人”。
4月22日， 在内蒙古自治区科技大会上，我校有三项科技成果受到自治区政府表彰。其中，李金泉教授主持的《内蒙古绒山羊育种方法的研究与应用》获2007年度自治区科技进步一等奖；赵士杰教授主持完成的《马铃薯生产关键装备及其技术的研究》获2007年度自治区科技进步二等奖；金曙光教授主持的《呼伦贝尔牧区奶业现代化生产奶牛科学饲养模式及饲草料优化配制》获科技进步三等奖；刘淑英教授主持的《褪黑素参与调节禽类生殖内分泌-免疫网络机制的研究》、王喜明教授主持完成的《水分移动引起木材皱缩形成机理的研究》获自治区自然科学三等奖。
4月25日，我校乒乓球队在驻呼高校乒乓球大赛上，获得男子团体、女子团体冠军。
4月25日，我校大学生志愿服务西部计划项目办被全国大学生志愿服务西部计划项目管理办公室授予“大学生志愿服务西部计划优秀项目办”荣誉称号。
4月25日，内蒙古骆驼保护协会成立大会在我校召开。大会选举产生了内蒙古骆驼保护协会第一届理事、常务理事、秘书长、副理事长、理事长，并表决通过了《内蒙古骆驼保护协会章程》。食品学院吉日木图当选为第一任会长。
4月29日，内蒙古植物生理学会成立大会在我校召开。大会选举产生了内蒙古植物生理学会第一届理事、常务理事、秘书长、副理事长、理事长，并表决通过了《内蒙古植物生理学会章程》。我校农学院张少英教授当选为第一届理事长。
5月4日，自治区纪念五四运动九十周年大会上，我校李国婧教授荣获“内蒙古十大杰出青年”称号，我校团委荣获“自治区五四红旗团委标兵”称号。
5月6日，第二十三届校园文化节开幕式暨“金马杯”文艺汇演在我校举行。
5月7-9日，我校第九届田径运动会在西区体育场举行。经济管理学院、职业技术学院和机电工程学院分会分别获得了学生团体总分前三名；食品科学与工程学院分会、理学院分会和生态环境学院分会分别获得了教工团体总分的前三名；生态环境学院等8个学院获得了学生组“体育道德风尚奖”。?机电工程学院分会等11个分会成为教工组“体育道德风尚奖”获奖单位。经济管理学院牛野同学以42.69m的好成绩打破了校男子学生铁饼记录。
5月8日，由自治区总工会等26家单位共同举办的感动内蒙古人物颁奖会上，无私捐献眼角膜的我校学生李莹荣获“2007-2008感动内蒙古人物”。
5月17日，第六届“学知识，长才干”测量技能大赛暨参加自治区测量技能竞赛选拔赛在我校举行。
5月17日，由内蒙古团委和内蒙古电视台联合举办、我校承办的“2009校园红歌会” 在我校举行。
内蒙古电视台新闻综合频道《新闻天天看》栏目主持人王芸和我校学子宋涛联袂主持了本场决赛。
5月20日，内蒙古农业大学学生党员“先进·先行·先锋”主题演讲比赛决赛在我校举行。
5月23日，我校举办“内蒙古农业大学第三届英语文化节”活动。
5月24日，由校团委主办、食品科学与工程学院承办的校园第六届饮食文化节在我校举行。
6月5 日，在内蒙古第四届“达内杯”ACM/ICPC大学生程序设计大赛中，我校代表队荣获一等奖。
6月8日，我校张和平教授、修长白教授荣获自治区人民政府表彰奖励的“2008年度自治区有突出贡献中青年专家”称号。
?6月10日，第二届感动内蒙古人物评选活动总结表彰大会上，我校荣获第二届感动内蒙古人物评选活动“优秀组织单位”奖，我校张璐、卜夕桐同学荣获第二届感动内蒙古人物评选活动“优秀志愿者”。
6月11日，我校水利与土木建筑工程学院王耀强教授和生态环境学院王立群教授荣获“自治区第三届高等学校教学名师奖”。
6月11日，在2009年自治区级高等教育教学成果奖评审中，由李畅游等完成的《蒙古语授课草原畜牧业生产类专业人才培养体系的改革与实践》、侯先志等完成的《基于“全员评价与激励”教学质量保障体系的实践》、侯振虎等完成的《发展性取向的心理健康教育服务模式的构建与实践》、葛茂悦等完成的《以多功能可持续实训基地为平台，创新“全程定岗、四步实训”实践教学体系》4项教学成果获一等奖。由王树森等完成的《网络技术支持下的植物分类学实践教学模式构建》、王春光等完成的《农牧业机械专业实验室的产学研结合建设模式》、王耀强等完成的《测量学实践教学模式研究》、朝伦巴根等完成的《水利类专业实践教学模式改革与实践》、裴喜春等完成的《高等院校农林类专业计算机教育课程体系的建设与教学实践》、郝拉柱等完成的《高等职业技术教育“目标跟踪式”人才培养模式研究与实践》6项教学成果获二等奖。
6月11日，我校应用化学、设施农业科学与工程、材料科学与工程、法学、旅游管理与服务教育、市场营销等六个专业增列为学士学位授予专业。
6月17日，我校史海滨教授主持的《灌溉排水工程学》、刘景辉教授主持的《耕作学》、朱守林教授主持的《道路建筑材料》、李国婧教授主持的《分子生物学》、李跃进教授主持的《土壤学》、云兴福教授主持的《花卉鉴赏与花文化》、段立清教授主持的《普通昆虫学》7门课程入选2009年度自治区级精品课程。
6月18日，我校举办首届“爱农杯”校园导游讲解大赛。
6月20日,教育部省部共建重点实验室建设项目通过验收了我校草业与草地资源教育部重点实验室。经过4年建设，凝炼出种质资源与育种、人工草地与草产品、草地资源与管理、草地生物灾害控制、草地荒漠化防治5个研究方向。建设期间培育牧草新品种5个，形成技术体系5个，制定标准2个，发表论文100余篇，承担各类科研项目100多个。
6月22日，由校团委主办，人文院承办的第二届礼仪知识大赛决赛我校举行。
6月25日，由校团委主办的“祖国万岁”合唱歌咏比赛在我校举行。
6月27日，在2009年全区大学生田径运动会上，我校取得了甲组女子团体总分第一、甲组男子团体总分第三、甲组团体总分第二的好成绩。其中，我校杨磊同学打破了内蒙古大学生男子组110m栏的纪录。我校职业技术学院获得女子团体总分第四名、男子团体总分第五名、团体总分第四名的成绩。我校丁小宽老师获“优秀教练员”奖，杨磊、韩淑芳获“优秀运动员”奖。
6月30日，我校曹德威、代丽、李雪琦、吕国玲、孟慧超、萨茹丽、吴琼、闫双红、杨溢、赵佳等十人荣获“内蒙古农业大学2009届十佳毕业生”荣誉称号。
7月3日，我校研究生院2009年毕业生共有633名。其中博士生78名，硕士生555名。
7月3日，内蒙古农业大学职业技术学院2009年毕业生共有1188名，其中本科生421名，专科生767名。
7月5日，在2009年全国大学生英语竞赛中，职业技术学院班董静和赵俊华两位同学获得一等奖。
7月10日，我校（校本部）2009年毕业生共有5253名。其中本科生4449名，专科生804名。
7月15日，我校生物工程学院与内蒙古金川保健啤酒高科技股份有限公司发酵工程专业研究生科研工作站成立。
7月15日，我校反刍动物生产教学团队、水资源保护与利用教学团队等2个教学团队被评为2009年自治区级教学团队。
7月18日，我校2009年度共推荐申报146个自治区自然科学基金项目，其中由李国婧教授主持的“旱寒荒漠区甜高粱秸秆纤维素生物转化关键技术研究”等47个项目获得资助，总经费171万元。
7月20日，召开纪念刘复初同志诞辰100周年座谈会并首发《刘复初传》。
7月23日，我校2009年暑期文化科技卫生“三下乡”社会实践活动全面展开。
7月25日，经国家环境保护部贝迩项目办公室专家组审核，日前已确定内蒙古农业大学成为BELL（贝迩项目（BELL：Business，Environment， Learning and Leadership)）中国可持续发展示范课程推广计划示范高校。
7月27日，自治区团委副书记刘春，自治区团委学校部部长贵曦之，清水河县副县长王再明等领导在我校清水河县社会实践基地指导工作。
7月27-31日，我校高教所所长、经济管理学院博士生导师盖志毅教授，人文学院格日乐图副教授参加“人类、发展与文化多样性”为主题的国际人类学与民族学联合会第十六届世界大会并做学术报告。‘
8月10日，科技部副部长杜占元在自治区科技厅厅长徐凤君、自治区信息化工作办公室主任张铁网、科技厅副厅长林莉陪同下视察我校。
8月15日 ，我校选送的“管道余能利用装置”等5项作品参加全国首届大学生水利创新设计大赛，其中四个作品获得二等奖，一个作品获优秀奖，我校获得“优秀组织奖”。在水利学科专业青年教师讲课竞赛中，参赛的两位青年教师都获得了一等奖。在全国水利高等教育分会水利教育指导委员会换届选举中，我校校长李畅游教授当选为中国水利教育协会高等教育分会新一届副理事长。
8月21日，内蒙古自治区马业协会(IMHIA)成立大会暨第一次会员代表大会上，我校芒来教授当选为协会副理事长兼秘书长。
8月24日,我校2009级新生开学典礼暨军训动员大会举行。我校2009年共招收11610名新生（含职业技术学院）。其中研究生776名（博士100名，硕士676名，其中学术型654、专业学位19）；本科生6630名；专科生1254名；成人2951名（函授2525，业余426）。
8月26日，内蒙古农业大学与日本鸟取大学签署了学术交流协议书。
8月28日，任命王效亮同志为我校职业技术学院党委书记（副厅级），葛茂悦同志为我校职业技术学院党委副书记、院长（副厅级）。
8月29日，李金泉副校长会见了来我校访问的澳大利亚查尔斯顿大学农学与酿酒科学学院院长约翰肯特和大卫肯普教授一行。两校签署了《内蒙古农业大学与澳大利亚查尔斯顿大学学术合作谅解备忘录》。
9月4日，人社部发［2009］107号文件批准，我校新设兽医学一级学科博士后科研流动站。至此，我校已有畜牧学、农业工程、林学、兽医学四个博士后流动站。
9月4日，我校水文与水资源工程、林学等2个专业被教育部、财政部批准为第四批国家级特色专业建设点。
9月7日，我校生态环境学院高永教授和人文社会科学学院苏娅教授荣获“全区师德先进个人”称号。
9月9日，我校举行庆祝第二十五个教师节座谈会。
9月11日，根据国家自然科学基金委员会公布的2009年度国家自然科学基金项目资助情况，我校有38个项目获得资助，总经费963万元。
9月14日，我校党委被授予“全国‘五五’普法中期先进单位”荣誉称号。
9月15日，我校能源与交通工程学院青年教师张捷荣获全国青年教师“师德”演讲比赛二等奖。
9月15日，家畜遗传繁育系列课程教学团队被教育部确定为2009年国家级教学团队，这是我校首次获批国家级教学团队。
9月16日，我校被确定为全区高校心理健康教育与咨询工作区域示范中心。
9月24日，我校今年全面启动节约型校园创建工程，改造内容包括建筑外围结构、室内供热系统计量及温度调控系统改造、热源及供热管网热平衡改造等。改造后冬季室内平均温度由15～18度提高到22度以上，实现节能50%以上。总投资达4000余万元并出资360万元对建筑年代较早的教工住宅楼进行更换窗户。
9月25日，我校获自治区2008年学生工作及维护稳定创建平安校园综合治理工作先进达标院校。
9月28日，在全国第二届大学生艺术展演中，我校选送舞蹈节目《狼图腾》获得艺术表演类甲组三等奖，我校获得优秀组织奖。
9月29日，我校举办庆祝新中国成立60周年专场文艺晚会。
10月10日，我校人文社会科学学院的侯振虎同志荣获“2009年全国优秀心理学工作者提名奖”。
10月14日，教育部工程教育认证专家组对我校水文与水资源工程专业进行认证。通过认证结论，有效期为3年。
10月17日，我校与阿拉善盟孪井滩生态移民示范区签署校区合作协议，阿拉善盟孪井滩生态移民示范区将在协议框架内为我校提供科研基地、研究资料及相关服务。我校将从科学研究、科研成果转化应用、人才培养等方面对阿拉善盟孪井滩生态移民示范区给予帮助与支持。
10月20日，我校周欢敏教授获内蒙古自治区中青年科学技术创新奖。
10月23日，自治区教育厅公布了2009年自治区品牌专业，我校自治区品牌专业有计算机科学与技术、植物保护、农业电气化与自动化、农业资源与环境等（本科）专业和旅游管理（高职）专业。
10月28日，在第十一届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛决赛中，我校农学院潘天遵同学的作品《水杨酸处理对甜菜丛根病抗病性的诱导》获三等奖。我校获得“优秀组织单位”荣誉称号。
10月30日，在第六届高等教育国家级教学成果奖获奖项目评选中，我校共有2项成果荣获国家级教学成果二等奖，既李畅游教授主持完成的《草原畜牧业蒙汉兼通专业人才培养模式的探索与实践》（成员有朝伦巴根、麻硕士、李金泉、杜健民、菊林花、阿木古楞、乌尼）；葛茂悦教授主持完成的《以多功能可持续实训基地为平台，创新“全程定岗、四步实训”实践教学体系》（成员有刘金泉、樊文斌、郭奇斌、陈广顺）。
10月30日，中国内蒙古农业大学与美国塔尔顿州立大学经友好协商，决定在科学研究、人员互访和课程建设等领域建立长期合作关系，双方签署了合作备忘录。
10月31日，我校教职工合唱团荣获自治区直属高校教职工庆祝新中国60华诞合唱比赛一等奖。
11月3日，学校召开会议传达部署推行公务卡工作，我校作为第五批推行公务卡的单位，将于2010年1月1日始在公务活动中正式使用公务卡。公务卡的使用范围包括邮电费、差旅费、会议费、招待费、医药费等有关商品和服务费。除校园基建和大宗仪器设备采购外，公务卡基本涵盖教学、科研、管理等各方面的日常现金支付。
11月4日，校团委、学生会对校第三届学生会进行了人员机构调整，产生第三届第二任学生会组织机构，麦拉苏任学生会主席，贾俊峰、奇特、张忡（同音字）、刘萌、黄瑞生、尹嘉璐任副主席。同时在整合广播站、彩虹网记者站等机构基础上增设了彩虹文化传媒中心。
11月4日，校党委会议审核通过食品科学与工程学院党员大会“公推直选”选举结果，任命张星杰同志为食品科学与工程学院党委书记。这是自治区高校首次通过“公推直选”产生基层党组织负责人。
11月5日，我校关工委被授予全区“先进关工委”称号。同时，材料科学与艺术设计学院关工委被授予“模范基层关工委”称号，于绍祥同志被授予“优秀工作者”称号。
11月8日，由中国马业协会秘书长、我校生物工程学院院长芒来教授撰写的《马在中国》一书首发仪式在武汉举行，标志着中国首部马业专著正式向全国发行。自治区主席巴特尔为该书题词：“爱马无疆”，中国科学院院士、中国马业协会理事长吴常信为该书作序。自治区政府秘书长乌兰巴特尔出席首发式并讲话。
11月18日，由我校教务处、学生处、团委及水利与土木建筑工程学院共同主办的首届水利创新设计大赛颁奖仪式暨第二届“腾飞桥梁”结构设计大赛开幕。
11月20日,我校朝伦巴根教授和云锦凤教授获2007年度内蒙古杰出人才奖,每人将获得20万元的杰出人才奖奖金。
11月22日，教育部部长袁贵仁接见我校李畅游校长和侯晨曦副校长。
11月24日，内蒙古农业大学与澳大利亚国西澳大学建立友好关系，双方签署了合作备忘录。
11月25日，举行我校科技创新团队答辩会，校领导李畅游、陈智、包赛音、王林和、侯先志、李金泉出席答辩会。科技创新团队答辩会的举行标志着我校科技创新团队培育计划正式启动。
11月26日，教育部聘任“草地资源”教育部重点实验室主任韩国栋教授，学术委员会主任云锦凤教授。
11月27日，在2009年内蒙古自治区大学生篮球赛中，我校代表队荣获甲组男子冠军、女子亚军的好成绩；职业技术学院代表队获得“体育道德风尚奖”，校运动员林洋获得“体育道德风尚奖”；我校彭恩获得“大赛优秀教练员”称号。
12月4日， 由我校 “乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生菌B.animalis?subsp.?lactis?V9全基因组序列测定于2009年11月30日全部完成。这是该实验室继2008年5月30日完成我国第一个益生乳酸菌L. casei?Zhang全基因组全序列测定之后，完成的我国第1个双歧杆菌基因组全序列测定。10月10日?将乳酸菌蛋白组学研究成果在《分子与细胞蛋白质组学》杂志（国际蛋白质组学顶级杂志）发表。10月27日益生菌全基因组图谱绘制入选2008年内蒙古科技十大进展。
12月7 日，我校举行第八届“新星魅力秀”校园主持人大赛决赛，食品科学与工程学院获得冠军。许政、安宁分别获得汉语最具潜力男主持和女主持奖；杜越获得汉语最佳人气主持奖；乌日乐获得蒙语最具潜力女主持奖；玛拉钦呼获得蒙语最具潜力奖；林学院获得团体最佳才艺奖。
12月7日，校党委任免决定：任命包庆丰同志为马克思主义教学研究部主任，免去人文社会科学学院院长职务；任命苏双平同志为马克思主义教学研究部副主任，免去人文社会科学学院副院长职务；任命盖志毅同志为人文社会科学学院院长。
12月8日，成立动物科学学院和兽医学院，原动物科学与医学学院撤销。聘任贾幼陵同志为兽医学院院长；任命李培峰同志为兽医学院党委书记，常务副院长；聘任呼和巴特尔同志为副院长。任命额尔敦同志为动物科学学院党委书记，主持行政工作；任命陆海平同志为党委副书记；任命张大鹏同志为党委正处级组织员；聘任敖长金同志为副院长。
12月9日，我校教务处组织申报高等学校本科教学质量与教学改革工程项目评选，取得成果。目前专业建设方面，我校已经有6个专业被批为“国家特色专业建设点”， 28个专业被评为自治区级品牌专业；课程建设方面，已有5门课程被批准为国家级精品课程，46门课程被评为自治区级精品课程；教学团队建设方面，已有1个国家级教学团队， 2个自治区级教学团队。
12月10日，自治区科技厅组织区内外知名专家对我校刘景辉教授承担的自治区自然科学基金重大项目、国家自然科学基金项目“燕麦治理荒漠化生态生理基础与技术体系研究”进行了成果鉴定。项目登记认定燕麦新品种2个，发表论文18篇，其中SCI收录2篇，ISTP收录1篇，全国中文核心期刊发表13篇；培养博士生4名、硕士生5名，完成博士学位论文4篇、硕士学位论文5篇。
12月17日，我校史海滨教授主持的《盐渍化地区水盐联合胁迫效应与节水灌溉应用研究》获2008年自治区科技进步一等奖，贾玉山教授主持的《柠条灌木地的生产生态模式研究》和赵满全教授主持的《秸秆饲草加工关键装备与技术的开发应用》获二等奖，王瑞刚教授主持的《新型抗栓药物枯草芽孢杆菌纤溶酶植物根系分泌生物反应器的建立》获自治区自然科学三等奖。
12月22日，举行“校园一卡通”启动仪式。校园卡是由我校与中国建设银行股份有限公司联合发行的面向农大教职工和学生的校园卡。此卡是由两张卡组成的套卡，一张是由中国建设银行发行的龙卡储蓄卡，另一张是校园非接触式IC卡，校园卡融合了中国建设银行龙卡储蓄卡先进的金融服务功能和校园IC卡的智能管理、消费功能，实现智能化的校园生活。
12月23日，内蒙古农业大学马克思主义教学研究部成立。
12月25日，内蒙古农业大学生物工程学院更名生命科学学院。
12月25日，以自治区高校纪工委书记程哲为组长的自治区行风评议检查组一行5人来我校检查指导工作。
12月29日，我校高聚林教授集成并编写的内蒙古自治区地方标准《内蒙古平原灌区玉米超高产栽培技术规程》、《内蒙古平原灌区玉米高产高效栽培技术规程》、《内蒙古自治区玉米高产田测产方法》及《内蒙古平原灌区青贮玉米高产栽培技术规程》，通过了由内蒙古质量技术监督局组织有关玉米生产、科研、推广专家组成的审定委员会的审定。